La pulizia dei pannelli fotovoltaici è un'operazione fondamentale per garantire un corretto funzionamento dell'impianto. Le celle solari sono infatti ricoperte da un vetro trasparente. Inquinanti atmosferici, rifiuti di uccelli, polveri ed altre impurità trasportate dal vento possono col tempo opacizzare la superficie del vetro riducendo così il passaggio della radiazione luminosa. La conseguenza di tutto ciò è un progressivo deterioramento del fattore di conversione del dispositivo che può diminuire di percentuali ragguardevoli dell'ordine del 25/30 %. Per impedire tutto questo è necessario programmare degli interventi di pulizia periodica dell'impianto. Ovviamente di tutte le sostanze che sporcano i pannelli le più deleterie sono i prodotti chimici trasportati dagli inquinanti e gli escrementi degli uccelli che possono incrostare in maniera duratura la superficie del vetro di protezione del pannello. La terra, polvere ed altre impurità trasportate dal vento vengono successivamente rimosse dalle piogge se i pannelli sono inclinati. Gli interventi di pulizia vanno generalmente fatti utilizzando acqua demineralizzata e spazzole non abrasive. Se lo sporco è tenace si utilizzano appositi cleaner che non sono abrasivi, sciolgono eventuali incrostazioni ostinate ed asciugando hanno una funzione antistatica che impedirà accumuli eccessivi di polvere per attrazione elettrostatica dovuta ad addensamento di cariche sulla superficie del pannello.